A Brief Guide to R (abg2r.matsuka.info) では以下の書籍・サイトを参考にしました/しています。

# R
R documentation / help
Art of R programming, ,O’Reilly
R cookbook, ,O’Reilly
The basics of S and S-Plus, Krause & Olson, Springer

# 統計・解析
データ解析テクニカルブック （吉田・森　編著、北大路書房）
多変量データ解析法（足立　著、ナカニシヤ出版）